番茄內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)Apx基因探針?lè)╭PCR試劑盒實(shí)驗(yàn)操作步驟
在完成反應(yīng)體系配制后,將PCR管或96孔板短暫離心,確保液體集中于管底,避免氣泡干擾。隨后將反應(yīng)板置于qPCR儀中,按照以下程序設(shè)置擴(kuò)增條件:
1. 預(yù)變性階段:95℃維持30秒,充分激活DNA聚合酶并打開(kāi)模板二級(jí)結(jié)構(gòu);
2. 循環(huán)擴(kuò)增階段:95℃變性5秒,60℃退火/延伸30秒(根據(jù)引物Tm值可微調(diào)),重復(fù)40個(gè)循環(huán);
3. 熔解曲線分析(可選):從60℃緩慢升溫至95℃,每0.5℃采集一次熒光信號(hào),驗(yàn)證擴(kuò)增特異性。
實(shí)驗(yàn)過(guò)程中需注意:
- 陰性對(duì)照:設(shè)置無(wú)模板對(duì)照(NTC)以排除污染風(fēng)險(xiǎn);
- 重復(fù)孔:每個(gè)樣本至少設(shè)3個(gè)技術(shù)重復(fù),確保數(shù)據(jù)可靠性;
- 熒光通道選擇:若使用探針?lè)?,需匹配儀器FAM/HEX等通道,避免信號(hào)串?dāng)_。
數(shù)據(jù)分析時(shí),采用ΔΔCt法計(jì)算目標(biāo)基因相對(duì)表達(dá)量。首先用內(nèi)參基因(如Actin)Ct值校正樣本間差異,再通過(guò)實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的Ct差值比較獲得表達(dá)倍數(shù)變化。若熔解曲線出現(xiàn)多峰或陰性對(duì)照出現(xiàn)擴(kuò)增,需排查引物二聚體或污染問(wèn)題。
為提高實(shí)驗(yàn)成功率,建議在正式實(shí)驗(yàn)前進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)優(yōu)化退火溫度及引物濃度。此外,試劑盒開(kāi)封后需分裝保存,避免反復(fù)凍融影響酶活性。通過(guò)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)牟僮髁鞒毯唾|(zhì)控步驟,可確保番茄Apx基因表達(dá)分析的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。
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